Фамилия Боржоян звучит как типичная армянская фамилия, и это верное первое впечатление. Её выдает суффикс -ян, который в армянском языке указывает на принадлежность к роду, происхождение от предка. Если убрать суффикс, останется основа Боржо. В ней отчетливо слышится топоним Боржоми — знаменитый грузинский курорт и источник минеральной воды. Однако связь здесь не прямая, а скорее фонетическая и географическая.

Скорее всего, фамилия Боржоян образована от названия населенного пункта Боржо (или Боржа) — такое село существует в Армении, в Арагацотнской области. Житель этого села получал прозвище Боржо, а его потомки стали Боржоянами. Второй, не менее вероятный путь — прозвище по ремеслу. В армянском языке слово «борж» может означать «борщ» или, в более широком смысле, «вариво», «похлебка». Тогда Боржо — это повар, человек, который варит еду. В таком случае фамилия перешла в разряд профессиональных.

Встречается версия, что фамилия связана с грузинским Боржоми. Она правдоподобна, но слабее двух предыдущих: армяне из региона Джавахети (исторически соседнего с Грузией) могли получить прозвище по месту, откуда приехали, но тогда форма была бы скорее Боржомян. Суффикс -оян (а не -омян) указывает на более короткую, местную основу, а не на сложное грузинское название.

С точки зрения словообразовательной модели, Боржоян — классический патроним (или матроним) с суффиксом -ян, который в русской передаче часто упрощается до -ян. В дореволюционных записях фамилия могла писаться через «ицу»: Боржоянцъ. Носители фамилии, как правило, выходцы из Западной Армении или исторической области Айрарат. В сословном отношении — это крестьяне или ремесленники, никакого дворянства за этой фамилией не числится.