Фамилия Ботодин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного «профессионального» или «географического» корня, который бросается в глаза, как у Кузнецова или Московкина. Чтобы понять её смысл, нужно разобрать словообразовательную модель и поискать аналоги в диалектах.

Самая вероятная версия — фамилия образована от прозвища или имени Ботода. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Ботодин, то есть сын или потомок Ботоды. Основа «ботод-» не встречается в русских святцах, но имеет параллели в диалектной лексике. В северных и сибирских говорах словом «ботало» называли колокольчик, привязываемый к шее коровы или лошади, а также деревянную колотушку для отпугивания рыбы. Прозвище Ботода могли дать человеку с громким голосом, болтливому или, наоборот, тому, кто работал с таким орудием — например, пастуху-ботальщику. Переход «ботало» → «Ботода» — типичное для русских прозвищ усечение или переоформление основы.

Менее вероятная, но лингвистически возможная версия — связь с глаголом «ботать» (бить, колотить, а в некоторых говорах — брести по воде, месить грязь). В этом случае Ботода — человек, который «ботает», то есть либо шумный, неуклюжий, либо связанный с рыбной ловлей (ботать рыбу — загонять её сеть ударами по воде). Такое прозвище могло закрепиться за крестьянином из северных губерний или Прикамья, где промысел был распространён.

Фамилия Ботодин — недворянская, крестьянская или мещанская по происхождению. Она не фиксируется в старых боярских списках и родословных книгах. Встречается спорадически: единичные носители есть в Пермском крае, Кировской области и на Урале — как раз в зоне бытования диалекта, где «ботать» и «ботало» были обыденными словами. В центральной России она практически не встречается, что косвенно подтверждает севернорусский или уральский след.

Интересно, что фамилия Ботодин входит в редкую группу фамилий на -один, где основа оканчивается на -од (ср. Борододин, Лободин, но они образованы от других корней). Это не суффикс, а часть прозвища, что делает фамилию морфологически нестандартной. Если бы корень был «бот», то фамилия звучала бы как Ботин или Ботов, но наличие -од- указывает на двухосновное или диалектное происхождение.

Таким образом, Ботодин — фамилия-загадка, уходящая корнями в народную речь северных и уральских крестьян. Предок её носителя, скорее всего, был пастухом, рыбаком или просто человеком с громким голосом, за которым закрепилось прозвище Ботода.