Фамилия Боймирзоев — яркий пример сложения восточных именных компонентов, застывших в русской паспортной форме. Она образована по модели, типичной для фамилий народов Средней Азии и Кавказа, но с русским суффиксом принадлежности -ов, который в XIX–XX веках при оформлении документов добавляли к любой основе.

В основе лежит составное имя Боймирзо (вариант — Боймирза). Первая часть, «бой» (от тюркского «бай»), означает «богатый», «господин», «хозяин». Вторая, «мирзо» (от персидского «мирза», «амирзаде»), восходит к титулу «сын эмира» или просто «писарь», «грамотный человек» в иранской и тюркской среде. Вместе имя Боймирзо можно перевести как «богатый господин» или «господин-писарь», причем второй компонент часто указывал на принадлежность к образованному сословию или знатному роду.

Таким образом, предок современного носителя фамилии, скорее всего, был человеком, которого окружающие называли почтительно-двойным именем. Это мог быть как местный старшина или зажиточный земледелец, так и грамотный чиновник низового уровня. Суффикс -ев (а не -ов) здесь возник по фонетическому правилу: после мягкого согласного (звук «з» в «мирзо» на стыке с суффиксом смягчился) пишется -ев.

Фамилия Боймирзоев распространена в Таджикистане и Узбекистане, а также среди выходцев из этих стран в России. Встречается и вариант Боймирзаев, где основа взята в более архаичной форме «мирза». Поскольку фамилия молодая (оформилась в советское время как отчество или запись по отцу), искать её в дореволюционных дворянских родословных бесполезно — это типичная «фамилия второго поколения», которая рассказывает не о сословии, а об имени деда.