Фамилия Боймирзаев — яркий пример того, как в русском языке закрепилась тюркская именная модель, пришедшая из Средней Азии. Её основа — составное мужское имя Боймирза, которое в узбекском, таджикском и туркменском языках складывается из двух частей: «бой» (богатый, господин, хозяин) и «мирза» (писец, знатный человек, а также компонент многих имён, восходящий к титулу «эмирзаде» — потомок эмира). Таким образом, имя Боймирза можно перевести как «богатый мирза» или «знатный господин», что указывало на высокое положение или желаемое будущее для ребёнка.

Русский суффикс -ев, присоединённый к основе, — классический способ оформления фамилий в Российской империи для нерусских народов. Он отвечает на вопрос «чей?» и означает принадлежность: Боймирзаев — сын Боймирзы. Такая модель массово закреплялась при переписях и паспортизации в XIX–XX веках, особенно среди оседлого населения Туркестана. Фамилия не могла возникнуть в русской крестьянской среде, потому что имя Боймирза нехарактерно для восточнославянского именослова.

Интересная деталь: в отличие от большинства русских фамилий на -ов, которые образовывались от крестильных имён (Иван — Иванов), здесь мы видим нецерковное, светское имя, получившее фамильное оформление. Это говорит о том, что предки носителя фамилии, скорее всего, были мусульманами, и фамилия фиксировала их родовое имя уже в условиях российского делопроизводства. В самой Средней Азии фамилии в современном понимании появились поздно, поэтому Боймирзаев — продукт именно русской административной системы, наложенной на местную традицию.

Встречаются варианты написания: Баймирзаев (через «а» в первом слоге), что связано с диалектным произношением. В русском языке ударение обычно падает на последний слог — Боймирза́ев, хотя в языках-источниках ударение может быть на первом или втором слоге. Фамилия распространена в Узбекистане, Таджикистане, а также в среде выходцев из этих республик в России. По сословному признаку предки Боймирзаевых могли быть как из торгово-ремесленной среды, так и из знати — само имя подразумевает определённый статус, но к XX веку оно стало общеупотребительным и не гарантирует аристократического происхождения.