Фамилия Божкеева — женская форма от Божкеев, и её разбор стоит начать с суффикса, который сразу выдаёт нерусское происхождение. Окончание -ев (а не -ов) часто встречается в тюркских фамилиях, особенно у народов Поволжья и Урала — татар, башкир, чувашей. Сама основа Божкей восходит к мужскому личному имени или прозвищу, которое могло быть образовано от тюркского слова «бож» (пустой, свободный, а также — в некоторых диалектах — «безрогий») с уменьшительным суффиксом -кей. В татарской ономастике такие формы характерны для имён-прозвищ, где корень указывал на внешность или свойство человека: «Божкей» могло означать «маленький безрогий» (в переносном смысле — смирный, неагрессивный) или «пустой, беспечный».

Есть и вторая, менее очевидная версия: связь с арабским именем Бажкей (вариант Бажгирей), которое через тюркское посредство могло исказиться в Божкей. Но для фамилии Божкеева этот путь менее вероятен, так как арабские имена обычно сохраняют более узнаваемую форму. Географически фамилия встречается в Башкортостане, Татарстане и среди казахских родов, что подтверждает её тюркские корни. В русских говорах слова «божка» или «божкей» не зафиксированы, поэтому славянская этимология (от «бог» или «божатый») отпадает — это была бы натяжка.

Интересно, что фамилия Божкеева почти не имеет однокоренных «близнецов» в русских списках. В отличие от, скажем, Божко или Боженко, которые встречаются на Украине, Божкеев — редкая форма, закреплённая в узком регионе. Это говорит о том, что предки носителей фамилии, скорее всего, жили компактно, в одном селе или ауле, и фамилия не получила широкого распространения через миграции. Социальный контекст: в XIX веке такие фамилии часто давали недворянским сословиям — государственным крестьянам, тептярям или башкирам-вотчинникам. Не имея точных записей, можно предположить, что первый Божкеев был либо рядовым общинником, либо мелким ремесленником, чьё прозвище со временем закрепилось за родом.