Фамилия Брафтова — редкий случай, когда основа не поддаётся бытовой логике. В ней нет ничего от ремесла, места или крестильного имени. Скорее всего, перед нами фамилия искусственного происхождения, образованная от фамилии или прозвища Брафт, которое, в свою очередь, восходит к немецкому или еврейскому корню. В немецком языке существует слово «Braft» (устаревшее, диалектное) — «храбрый», «отважный», но эта версия слаба, так как слово практически не встречается в источниках. Правдоподобнее другое: Брафт — это вариант фамилии Брафман, Браф, которые могли принадлежать выходцам из немецкоязычных земель или еврейским переселенцам, получившим фамилию при переходе в православие или при записи в ревизские сказки.

Суффикс -ов- в женской форме Брафтова указывает на русскую адаптацию: фамилия была русифицирована по модели «чей?» — «Брафтов», то есть «сын Брафта». Такое часто происходило в XIX веке, когда иноязычные фамилии получали русское окончание для единообразия документов. Географически фамилия почти не встречается: по открытым данным, носители Брафтовых единичны и сосредоточены в центральной России и на Урале, что говорит о позднем и случайном закреплении.

Есть и альтернативная, более экзотическая версия: Брафт могло быть искажением фамилии Браун или Брауфт при переписи. Но она не находит подтверждения, так как ни одна из этих форм не даёт устойчивого написания. Таким образом, Брафтова — это, скорее всего, след миграции или социального лифта: предок носителя получил фамилию при переходе в другую культуру, и она сохранилась в почти нетронутом виде, став свидетельством сложных этнических процессов в Российской империи.