Фамилия Брахунцов — одна из тех, где корень не лежит на поверхности, а суффикс сразу указывает на модель образования. Суффикс -ов- здесь стандартный, патронимический: он превращает прозвище или имя отца в родовое имя. Значит, в основе лежит слово «Брахун» или «Брахунц», от которого и пошла фамилия.

Корень «брах-» сразу вызывает ассоциации с глаголом «брахать» — в русских говорах это значит «стучать, греметь, колотить». В диалектах слово «брахун» могло означать шумливого, неугомонного человека, который всё роняет или громко говорит. Есть и другая версия: в некоторых областях «брахать» — это «лгать, врать» (сравните с «бред» и «брехать»). Тогда Брахун — прозвище пустомели или хвастуна. Какая версия правдоподобнее? Скорее первая, потому что в русской ономастике прозвища по звуковым особенностям поведения (стук, грохот) встречаются часто, а вот корень «брех-» обычно даёт фамилии вроде Брехунцов, с другим вокализмом.

Интересна и форма «Брахунцов», а не более ожидаемое «Брахунов». Суффикс -ец- в основе указывает на то, что прозвище было образовано по модели «Брахун + -ец», то есть «Брахун» — это человек, а «Брахунц» — его сын или потомок (сравните: «купец» — «купеческий сын»). Такая двойная суффиксация — признак того, что фамилия могла закрепиться не в центральных, а в южнорусских или украинских говорах, где -ец- в прозвищах встречается чаще. Встречается фамилия в документах по Курской и Воронежской губерниям, что подтверждает южный след.

В социальном плане Брахунцовы — скорее всего, потомки крестьян или однодворцев. Фамилия не дворянская, не купеческая, её нет в родословных книгах. Она бытовала в среде, где прозвища давали по бытовым чертам: по шуму, который человек производил при работе, или по его манере говорить. Таким образом, предок Брахунцовых мог быть плотником, кузнецом или просто громогласным мужиком, чья особенность запомнилась соседям и перешла в фамилию.