Фамилия Братун — яркий пример того, как прозвище, данное по родственной связи, со временем закрепилось в качестве официального родового имени. В её основе лежит древнерусское слово «брат», но не в значении «родной брат», а скорее как ласковое или шутливое обращение к товарищу, другу, побратиму. Суффикс -ун в русском языке часто образует существительные со значением лица, склонного к какому-либо действию или обладающего определённым качеством (например, «говорун», «молчун», «крикун»). В случае с Братуном этот суффикс придаёт основе оттенок ласкательности и постоянного свойства: «братун» — тот, кого все считают своим, близкий человек, «свой в доску».

Модель образования фамилии — типично украинская и южнорусская. В Белоруссии и на западе России фамилии на -ун встречаются реже, а вот в Черниговской, Полтавской, Харьковской губерниях, а также в приграничных областях России (Курской, Воронежской) такие формы — обычное дело. Фамилия Братун могла возникнуть и без суффикса, а как прямое прозвище: в диалектах «братун» — это и обращение к младшему родственнику, и просто «дружище». Ономасты отмечают, что подобные фамилии (Хатун, Шурун, Сватун) часто возникали в среде казачества и крестьянства, где прозвища были короткими, ёмкими и передавали характер человека.

Спорных версий происхождения у фамилии Братун, по сути, нет. Отпадает версия о связи с тюркским корнем — слишком прозрачна славянская основа. Не стоит путать её и с фамилией Братухин, образованной от уменьшительной формы имени Братуха. Братун — это самостоятельная модель, где суффикс -ун выполняет ту же роль, что и в фамилиях Веселун, Болтун, Хвастун. Предок носителя этой фамилии, скорее всего, был человеком общительным, открытым, заслужившим прозвище «братун» за то, что ко всем относился по-братски, или же сам был младшим в роду, которого так ласково называли старшие.

В архивных записях фамилия встречается с XVII века. Например, в реестрах Войска Запорожского есть упоминания казаков с таким прозвищем. В метрических книгах XIX века Братуны часто фиксируются в сёлах современной Сумской и Полтавской областей. География бытования до сих пор остаётся преимущественно украинской и южнорусской, хотя в XX веке фамилия распространилась по всей стране. Сейчас она нечастотна, но не является исчезающей — её носители живут и в России, и на Украине, и в Белоруссии.