Фамилия Бартун — редкий случай в русском ономастиконе, где форма на -ун не является типичным суффиксом фамилии, а скорее сохраняет следы западнославянского или балтийского влияния. В русских фамилиях суффикс -ун обычно указывает на лицо по действию (крикун, говорун), но в роли фамильного окончания он почти не встречается. Поэтому первое, что приходит в голову: Бартун — это не фамилия, образованная по русской модели, а либо прозвище, либо фамилия, пришедшая с запада.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с немецким Barth или Barthold — краткой формой имени Бартоломью (Варфоломей). В немецкой среде фамилия Barth распространена, а при переходе в русскую речь к ней мог добавиться суффикс -ун, который в украинском и белорусском языках часто придаёт прозвищный оттенок (например, Грицун, Петрун). Тогда Бартун — это «сын или человек Барта», то есть потомок Варфоломея. Такая модель встречается на землях, где смешивались немецкие колонисты и восточнославянское население — в Галиции, на Волыни, в Прибалтике.

Менее очевидная, но возможная версия — от литовского bartus, что означает «бородатый» или «сердитый». В литовском языке есть фамилия Bartūnas, которая при переходе в польскую или белорусскую среду могла сократиться до Бартун. География фамилии это подтверждает: в современных данных Бартуны встречаются в основном в Беларуси и на западе России, особенно в Псковской и Смоленской областях, что исторически было зоной контакта балтийских и славянских племён.

Третья версия, самая редкая, — от древнерусского прозвища «бартун» со значением «боец», «драчун», но надёжных лингвистических подтверждений этому нет. В словарях древнерусского языка слово «бартун» не фиксируется, поэтому эта гипотеза остаётся умозрительной.

Таким образом, носители фамилии Бартун с высокой вероятностью имеют предков из западных регионов бывшей Речи Посполитой или Прибалтики, где фамилия могла возникнуть как прозвище потомка Варфоломея либо как адаптация балтийского корня. Суффикс -ун в данном случае — не русский патронимический, а региональный, характерный для украинского, белорусского и польского прозвищного словообразования.