Фамилия Брегеда звучит необычно для русского уха, и её происхождение вызывает несколько версий. Сразу заметно, что в основе лежит не каноническое имя, а прозвище, и корень слова, скорее всего, не славянский, а заимствованный.

Первая и самая вероятная версия связывает прозвище Брегеда с украинским словом «брегет». Так называли очень точные карманные часы. Слово это, в свою очередь, произошло от фамилии французского часовщика Абрахама-Луи Бреге (Breguet), чьи механизмы славились безупречным ходом и ценились по всей Европе. Прозвище Брегеда мог получить либо часовщик, либо владелец дорогих часов, либо человек, который следил за временем с педантичной точностью. Модель образования фамилии здесь аналогична украинским фамилиям на -а: если Иваненко — «сын Ивана», то Брегеда — «человек, связанный с брегетом».

Вторая версия отталкивается от слова «брег» — берег. Прозвище могли дать человеку, жившему на берегу реки или озера. Это распространённый тип прозвищ по месту жительства. Однако против этой версии говорит то, что фамилия с корнем «брег» обычно давала бы формы Береговой или Брегов, а не Брегеда. Суффикс -еда в этой модели выглядит чужеродно.

Третья, более экзотическая гипотеза, ведёт прозвище от слова «бриг» — двухмачтовое военное или купеческое судно. Согласно этой версии, Брегедой могли назвать мореплавателя, корабела или человека, связанного с флотом. Чередование гласных е/и (бриг — брегеда) объясняется влиянием «екающих» говоров, где в безударном положении «и» звучит как «е». Эта версия возможна, но менее правдоподобна, чем первая: слово «бриг» — книжное, морской термин, и вряд ли оно стало бы бытовым прозвищем в крестьянской среде.

Самое правдоподобное объяснение — прозвище по профессии или характерной черте, связанной с часами. Фамилия Брегеда — редкий пример того, как имя знаменитого изобретателя превратилось в народное прозвище, а затем закрепилось в родовом имени.