Фамилия Брунковская образована по польско-украинской модели: суффикс -ская (женская форма, от мужского -ский) указывает на дворянское или шляхетское происхождение, но на восточнославянских землях такую фамилию мог получить и крестьянин, переселившийся из другого села. Основа — прозвище Брунко.

Прозвище Брунко происходит от малороссийского (украинского) слова «брунка» — «балалайка». Значит, первый носитель прозвища либо мастерил балалайки, либо был музыкантом. Есть и вторая версия: от диалектного глагола «брунчать» — «бренчать, звенеть, жужжать». В таком случае Брунком могли прозвать человека со звонким, запоминающимся голосом или неумолчного болтуна. Оба объяснения опираются на одну звукоподражательную основу — подражание бренчанию струн или жужжанию.

В документах фамилия могла писаться как Брунковский (мужской вариант) и Брунковская (женский). Географически она тяготеет к западным и центральным областям Украины, где модель фамилий на -ский особенно распространена. В России фамилия встречается редко — чаще всего у потомков переселенцев из Малороссии.

Интересная деталь: прозвище Брунко закрепилось как наследственное имя до того, как к нему добавился суффикс -ский. Это значит, что предок носителя фамилии был известен в своей местности именно под этим прозвищем, и только позже, при оформлении официальных документов, к нему прибавили дворянский или территориальный суффикс.