Фамилия Бруньковская — яркий пример того, как географическое название становится родовым именем. Её основа — топоним Бруньково или Бруньков, а суффикс -ск- указывает на принадлежность к местности. Такая модель типична для польской, украинской и белорусской шляхты: по названию имения или местечка образовывали фамилию, которая закреплялась за потомками. Поэтому Бруньковская — почти наверняка вариант женской формы от мужской Бруньковский, а не самостоятельное образование.

Корень «брунь-» в славянских языках имеет несколько значений. На юго-западе, в украинском и белорусском, «брунька» — это почка растения, а также небольшой бугорок или нарост. В польском «brunia» — старинное название брони, доспеха, но это скорее редкая параллель. Вероятнее всего, название поселения Бруньково (или Бруньков) возникло от прозвища первого поселенца по характерной внешности — скажем, невысокого, коренастого человека, «бруньки», или по природному признаку — места, поросшего кустарником, где много почек. Встречается и версия, что «брунь» — диалектное название плохой, тяжёлой земли, что тоже могло лечь в основу названия деревни.

География фамилии указывает на западные регионы бывшей Речи Посполитой. Наибольшая плотность носителей — в западной Украине (Волынь, Подолье, Галичина), в юго-восточной Польше и в Беларуси. В Российской империи после разделов Польши фамилия фиксировалась среди дворян и однодворцев, но не была массовой. В метрических книгах XIX века Бруньковские встречаются как униаты и католики, что подтверждает западнорусское происхождение.

Стоит отметить, что фамилия не имеет отношения к брюнетам или слову «брунет» — это случайное созвучие. Также нет оснований связывать её с «брунькой» как видом рыбы (бычок-брунька) — это узколокальный термин, не давший устойчивых фамилий. Таким образом, Бруньковская — это «та, что из Брунькова», и её корни — в названии небольшого поселения на западе славянского мира, где когда-то жил человек с прозвищем Брунь или где земля была бруньковатой.