Фамилия Бубнюк напрямую связана со звуками — либо с человеческой речью, либо с музыкой. В основе лежит одно из двух слов: «бубнить» или «бубен». Первый вариант очевиден: если предка прозвали Бубнюком за манеру говорить глухо, невнятно, монотонно или ворчливо, то фамилия отражает особенность характера или поведения. Второй вариант — прозвище от «бубен», ударного инструмента в виде обода с кожей. Здесь возможны два пути: либо предок был музыкантом или мастером, делавшим бубны, либо прозвище дали за бедность — по пословице «Гол, как бубен».

Ключевая деталь — суффикс -юк. Это типичный украинский или западнорусский патронимический суффикс, указывающий на происхождение: Бубнюк буквально означает «сын (или потомок) Бубна» или «человек, относящийся к Бубну». Такая модель образования фамилий широко распространена на Волыни, Подолье, в Галиции и на юго-западе современной Беларуси. То есть географически фамилия Бубнюк скорее всего привязана к западно- или южнорусским землям бывшей Речи Посполитой.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые встречаются повсеместно, Бубнюк — редкий случай, где прозвищная основа и суффикс сразу выдают регион происхождения. Спор между двумя версиями («бубнить» vs «бубен») неразрешим без конкретных записей XVI–XVII веков, но обе правдоподобны: прозвища часто давали по поведению или по занятию, а бедность и музыка — не менее частые поводы для именования, чем ворчливость.