Фамилия Буболев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить стандартные модели, сразу заметна её основа: «буб-» и суффикс «-олев». В русских фамилиях суффикс «-олев» встречается нечасто, чаще он указывает на адаптацию иноязычного корня или на прозвище, образованное через уменьшительно-ласкательную форму. В данном случае, скорее всего, перед нами фамилия, возникшая от прозвища Буболь.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «бубень» или «бубон» — так в некоторых русских говорах называли бубенчик, колокольчик или просто звонкий предмет. Отсюда Буболь — человек, который либо торговал бубенчиками, либо носил их на одежде (как скоморох или ямщик), либо сам был звонким, болтливым, шумным. Суффикс «-оль» в прозвищах (ср. Гоголь, Коболь) придавал оттенок ласкательности или ироничности.

Есть и альтернативное объяснение, менее распространённое: основа могла восходить к украинскому или белорусскому «бубка» (почка, шишка) или «бубля» (пузырь, водянка). В таком случае прозвище Буболь давали человеку с заметной припухлостью или полнотой. Однако эта версия слабее, так как суффикс «-олев» в восточнославянских фамилиях чаще встречается именно в контексте звукоподражательных или ремесленных прозвищ.

Фамилия Буболев — явно недворянская и не из числа искусственных семинарских. Она относится к крестьянскому или мещанскому сословию, причём географически её корни, вероятно, лежат в северных или центральных губерниях России, где диалектное слово «бубень» было в ходу. В документах XIX века такая фамилия встречается единично, что подтверждает её локальный, а не массовый характер.