Скорее всего, прозвище Бубяка восходит к слову «буба» - «ушиб, опухоль, болячка». Таким образом, эта фамилия могла указывать на внешние особенности или болезнь предка. Согласно другой версии, это прозвище связано со словом «бубен». Помимо музыкального инструмента в старину бубном иногда называют промотавшегося человека. Так, в Сибири говорят: «Гол, как бубен» или «Проигрался, как бубен». Не исключена также связь фамилии Бубякин с ярославским диалектным словом «бубень» - «лентяй, тунеядец». Согласно ещё одной версии, прозвище Бубяка восходит к глаголу «бубнить», то есть «неразборчиво говорить что-то под нос, постоянно что-то твердить». Таким образом, прозвище Бубяка могло указывать на особенности поведения предка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бубяка, со временем получил фамилию Бубякины.