Фамилия Бусилков — редкий пример, когда суффикс -к- в основе прозвища перешёл в фамилию, а не появился на стадии оформления. В большинстве русских фамилий на -ов суффикс -к- стоит перед фамильным окончанием и указывает на уменьшительную форму имени или прозвища: Иванов от Иван, но Ивашков от Ивашко. У Бусилкова разбор иной: основа «Бусилк-» уже содержала суффикс -к-, а фамилию образовали по стандартной модели — добавлением -ов. Это значит, что прозвище предка звучало как Бусилко.

Корень «бус-» многозначен и даёт две равновероятные версии. Первая — от диалектного «буса» или «бусина», то есть «пьяный», «хмельной». В южнорусских и украинских говорах «бусий» означало «напившийся», а «бусило» — человека, который часто выпивает. Вторая версия — от «буса» в значении «мелкий дождь», «морось» (владимирские и костромские говоры). Тогда Бусилко — прозвище человека, который «моросит», то есть надоедлив, плаксив или нерешителен. Менее вероятна связь с «бус» как «пыль» или «мучная пыль» — в этом случае прозвище мог получить мельник или пекарь, но такая основа реже даёт суффикс -ил-.

Суффикс -ил- в прозвищах характерен для деятеля: он обозначал человека по действию или свойству (ср. Громило, Воротило). Бусилко — тот, кто «бусит», то есть либо пьёт, либо моросит. Фамилия встречается в основном на юге России и в восточной Украине, что подтверждает первую версию: в этих регионах «буса» как «пьянство» — устойчивое слово. В центральных областях фамилия почти не фиксируется, что косвенно говорит против версии с дождём.

В дореволюционных документах фамилия могла писаться через «ы» — Бусылков, что не меняет значения, но указывает на твёрдое произношение корня. Сословно носители — скорее всего, крестьяне или однодворцы: прозвище бытовое, без книжной или церковной окраски. Фамилия не входила в дворянские родословные книги, что типично для прозвищных образований с суффиксом -к-.