Фамилия Бутпаев явно тюркского происхождения, и её разумнее всего рассматривать в контексте казахской или башкирской антропонимии. Основа «Бутпай» — это личное имя или прозвище, которое в тюркских языках может восходить к двум разным корням. Первый и наиболее вероятный: «бут» (нога, бедро) + аффикс принадлежности или уменьшительности. В таком случае Бутпай — это человек с характерными ногами (например, хромой, быстроногий или обладатель кривых ног — в прозвищах такое встречается сплошь и рядом). Вторая версия, менее очевидная, но тоже возможная: имя связано с глаголом «бут» (кончаться, иссякать) в каком-то диалектном значении — тогда прозвище могло относиться к небогатому или последнему ребёнку в семье.

Суффикс «-ев» — это русский патронимический формант, который в XIX-XX веках массово добавляли к тюркским фамилиям при переходе на оседлость и документировании в Российской империи. То есть первоначальная форма звучала как Бутпай (имя), затем Бутпайулы (сын Бутпая) у казахов, а при записи в метрики или ревизские сказки её «обрусели» стандартным окончанием. Интересно, что в Казахстане фамилия Бутпаев встречается чаще всего в Западном Казахстане и Актюбинской области — это указывает на возможную родовую привязку к Младшему жузу.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то в той же среде бытуют Бутбаев, Бутпаев, Бутов — все они от разных диалектных вариантов одного корня. Но Бутпаев стоит особняком: вторая часть «-пай» в тюркских именах часто имеет значение «богатый, изобильный» (ср. Алпай, Кенбай), так что не исключено, что имя Бутпай изначально было пожелательным — «крепконогий, устойчивый», то есть здоровый физически. Это делает фамилию не просто прозвищем по ноге, а скорее характеристикой силы и выносливости.

Сословно предки Бутпаевых, скорее всего, были скотоводами или воинами-кочевниками. Фамилия не дворянская, не купеческая — она из тех, что появились у простых казахов в XVIII-XIX веках, когда царская администрация начала фиксировать «инородцев» по отчеству. Никаких громких исторических личностей с такой фамилией в общем доступе нет, что типично для массового пласта тюркских фамилий, не попавших в элиту.