Фамилия Чалухина — женская форма фамилии Чалухин, и её происхождение стоит искать не в очевидных тюркских или кавказских корнях, а в русской диалектной лексике. Основа «чалух» или «чалуха» в ряде говоров (прежде всего северных и сибирских) означала нечто несуразное, нескладное, либо человека с неловкой походкой. В словаре Владимира Даля зафиксировано слово «чалый» — о масти лошади (серый с примесью другого цвета), но именно форма «чалух» могла быть прозвищем для сутулого, косолапого или неуклюжего человека. Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Чалуха), то есть предок носителя фамилии носил прозвище Чалух.

Географически фамилия редкая и тяготеет к центральным и южным регионам России, хотя встречается и в документах по Сибири. Основной ареал — Курская, Воронежская, Ростовская области, что наводит на мысль о возможном украинском или белорусском влиянии: в этих языках «чалуха» могло быть вариантом слова «цалуха» (поцелуй) или производным от «чалий» (серый, седой). Однако более правдоподобна версия с прозвищем от диалектного глагола «чалать» — ковылять, хромать. В таком случае Чалухин — потомок человека, которого в деревне прозвали за походку или внешность.

Интересно, что фамилия не имеет отношения к распространённому тюркскому корню «чал» (седина, старик) — в русской среде она переосмыслялась иначе. В дореволюционных переписях Чалухины встречаются среди крестьян и мещан, дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Женская форма Чалухина, как и большинство русских фамилий на -ина, не меняла значения, а лишь указывала на женщину из рода Чалухиных. Сегодня фамилия остаётся малочисленной, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска: каждый носитель может проследить свою ветвь до конкретного прозвища предка.