Фамилия Чарухина — женская форма мужской фамилии Чарухин, и её происхождение ведёт нас к прозвищу или имени, которое давно вышло из обихода. Основа здесь — «Чаруха». Это слово могло быть вариантом древнерусского имени Чарута или производным от глагола «чаровать» — колдовать, ворожить. Если так, то прозвище Чаруха давали человеку, которого считали колдуном, знахарем или просто обладающим необычной, притягательной силой. В народе «чарухой» могли называть и ворожею, и человека с гипнотическим взглядом.

Однако есть и более бытовая версия. В северных и уральских говорах «чаруха» — это небольшая деревянная чаша, ковш для питья. В этом случае прозвище мог получить резчик по дереву, бондарь или любитель выпить. Обе гипотезы имеют право на жизнь, но первая — с колдовским оттенком — встречается в ономастике чаще, так как прозвища по магическим свойствам были распространены на Руси: вспомните фамилии Ворожейкин, Колдунов, Шептунов.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Чарухин — тот, кто из рода Чарухи, сын Чарухи. Такая модель типична для прозвищ и неканонических имён, оканчивающихся на -а. Фамилия не относится к дворянским или княжеским — она крестьянская или мещанская, что подтверждается её бытованием в основном в центральных и северных губерниях России. Встречается она и сегодня, но нечасто, что делает её редкой и сохранившей память о прозвище, которому не меньше четырёхсот лет.