Фамилия Чарухиду — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с исконно русскими корнями. В русском языке нет продуктивных моделей, которые могли бы породить такое окончание. Основа «Чарухид-» не разлагается на славянские суффиксы и приставки, а финаль «-у» и «-иду» указывает на греческое или новогреческое влияние. Скорее всего, это фамилия греческого происхождения, зафиксированная в России в результате миграций или исторических контактов, особенно среди понтийских греков.

В греческом языке фамилии на «-иду» (или «-иди») — типичная патронимическая модель, означающая «сын» или «потомок». То есть Чарухиду — это «сын Чаруха» или «из рода Чаруха». Сама основа «Чарух» может восходить к греческому слову «чарус» (χαρούς) — «радостный», «весёлый», или к турецкому «чарык» (çarık) — вид кожаной обуви, постолы. Второй вариант правдоподобнее: в среде понтийских греков, долго живших в Османской империи, прозвище «сапожник» или «тот, кто носит чарыки» легко могло закрепиться как фамилия. В русском контексте окончание могло адаптироваться как «-иду» вместо более привычного греческого «-иди» из-за особенностей произношения или записи в паспортах.

Встречаемость фамилии в России крайне низкая. Основной ареал — южные регионы (Краснодарский край, Ростовская область), где исторически компактно селились греки, а также крупные города, куда они мигрировали в XX веке. Иногда фамилию путают с похожей по звучанию, но совершенно другой по корню русской фамилией Чарухин (от прозвища Чаруха — возможно, от «чарка» или диалектного «чаруха» — «кривой, косой»), но это разные фамилии.

Таким образом, носитель фамилии Чарухиду в России — почти наверняка потомок греческих переселенцев, а его предок мог получить прозвище по роду занятий (сапожник) или по характерной черте (весёлый человек). Фамилия сохранила греческую патронимическую форму, что редкость для русской среды, и сегодня является ярким маркером этнической истории семьи.