Фамилия Чекорина — женская форма, а её мужской вариант — Чекорин. В основе, скорее всего, лежит прозвище или нецерковное имя Чекоря. Такие имена на -оря были в ходу в северных и центральных говорах: вспомним фамилии Чистяков (от Чистя), или, например, Коряга. Что могло значить слово «чекоря»? Тут два пути, и оба ведут к диалектной лексике.

В словарях русских говоров «чекоря» — это «закорючка», «крючок» или «кривое дерево». Человек с таким прозвищем мог быть сутулым, хитрым или иметь какую-то заметную внешнюю особенность — например, кривые ноги или цепкие руки. Вторая версия, более редкая: в некоторых говорах «чекорить» означало «цепляться», «придираться». Тогда Чекоря — придирчивый, въедливый человек. Поскольку фамилия образована с помощью суффикса -ин, она указывает на прямую принадлежность: «чей?» — «Чекорин», то есть сын или потомок Чекори.

Географически фамилия Чекорин встречается в основном на Русском Севере и в Поволжье, особенно в бывшей Вятской губернии (современная Кировская область и Удмуртия). Там диалектные прозвища в основе фамилий — обычное дело. В отличие от более распространённых фамилий на -ов, суффикс -ин часто закреплялся за основами, оканчивающимися на -а или -я, что и подтверждает слово «Чекоря». Встречается также вариант написания с одной «р» — Чекорин, но это скорее искажение при переписи или упрощение.

Социальный состав носителей фамилии был разным: от крестьян до купцов. В документах XVIII–XIX веков Чекорины числились среди государственных крестьян и мещан в Сарапульском и Глазовском уездах. Знаменитых носителей фамилии нет, что типично для фамилий, возникших из диалектных прозвищ: они редко попадали в дворянские родословные книги.