Фамилия Чекотков образована от прозвища или имени Чекоток, а тот, в свою очередь, — от глагола «чекотать». В русских говорах это слово означало «частить, стучать, щёлкать, издавать дробный звук». Человек, получивший такое прозвище, мог быть говорливым, суетливым, либо же заниматься делом, связанным с ритмичным стуком — например, быть плотником (стук топора), кузнецом (удары молота) или мельником (стук жерновов). Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «чека» — деревянная часть оглобли, что могло указывать на мастера по изготовлению телег или саней.

Суффикс -ов типичен для русских фамилий, указывая на принадлежность («чей?» — сын Чекотка). Более редкий вариант — Чекотков, а не Чекоткин, что говорит об окончательном закреплении формы через суффикс -ов, а не -ин, хотя основа на -ок могла бы дать и вторую модель. Здесь сработала стандартная схема: прозвище на -ок → Чекоток → Чекотков, с усечением гласной при склонении (как Сорокин от Сорока, но в этом случае — с сохранением суффикса).

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и северных областях России — в Вологодской, Архангельской, Костромской губерниях, где активно бытовали говоры с глаголом «чекотать». В документах XVII–XVIII веков могли фиксировать крестьян или посадских людей с таким прозвищем, но массового распространения фамилия не получила. Ономастические словари (например, работы Б. Унбегауна) прямо не разбирают Чекоткова, но модель «основа на -ок + -ов» описана как типичная для прозвищ, характеризующих поведение или занятие.

Спорных версий немного: иногда пытаются связать фамилию с тюркским «чекот» (вид птицы) или с «чека» (деталь оружия), но это натяжки — русская глагольная основа лежит на поверхности и объясняет значение куда естественнее. Таким образом, Чекотков — фамилия, прямо указывающая на предка, которого в деревне знали как бойкого, шумного или мастерового человека, работавшего со стуком.