Фамилия Чепусев — редкий пример, где основа не отсылает ни к профессии, ни к имени, а к звуку или диалектному слову. Разбирать её стоит не с корня, а с суффикса: -ев указывает на русскую патронимическую модель, но в отличие от -ов, который крепится к основам на твёрдый согласный, -ев появляется после мягких или шипящих (как в Чепусев). Это говорит о том, что исходное прозвище заканчивалось на мягкий согласный — скорее всего, на -сь.

Самая прямая версия: прозвище Чепусь или Чепуса дали человеку, который «чепушил» — то есть нёс вздор, болтал ерунду, путал слова. В русских говорах «чепушить» означало «говорить пустое, врать», а «чепуха» — вздор. Фамилия образована от этого глагола: основа чепус- плюс суффикс -ев. Менее вероятно, но возможно, что корень связан с диалектным «чепурить» (чистить, прихорашиваться) — тогда прозвище Чепуса могло означать «чистюля» или «щёголь». Но семантика «болтун» встречается в народной речи гораздо чаще.

Географически фамилия тяготеет к центральной России и Поволжью. Встречается в старых переписях Симбирской и Казанской губерний, но не массово — это редкая фамилия, не попавшая в списки дворянских родов. Скорее всего, предки Чепусевых были крестьянами или мещанами, а прозвище закрепилось за одним родом в конкретной деревне.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Чепурин, Чепуров) показывает, что Чепусев стоит особняком: в нём нет уменьшительного суффикса -ин или -ур-, а основа чисто глагольная. Это делает фамилию более древней по модели — её могли дать по живому прозвищу взрослому человеку, а не по имени отца.