Фамилия Черницький — классический пример восточнославянской фамилии на -цький (польское -cki, украинское -цький). Эта модель образования указывает на географическое происхождение: такую фамилию получал человек, который жил в селе или городе с названием Черниця, Черниці или Черніца. Таких топонимов на территории современной Украины, Беларуси и восточной Польши несколько — например, село Черниця в Львовской или Ровенской областях. Суффикс -цький в этой системе значит «выходец оттуда», «тот, кто родом из Черницы».

Основа фамилии — «черн-», от слова «чёрный». В названиях поселений «Черница» могла означать либо тёмную, чёрную речку или болото (по цвету воды или торфа), либо местность, где селились «чернецы» — монахи (от «чёрное духовенство»). Второй вариант нередок для сёл, возникших при монастырях. Таким образом, предок носителя фамилии Черницький мог быть крестьянином или мещанином, переселившимся из одного из таких сёл, и его прозвали по месту прежнего жительства.

Фонетический облик фамилии — с мягким знаком и окончанием -цький — характерен для украинской ономастики. В русском языке эта фамилия часто записывалась как Черницкий, без мягкого знака, что отражало адаптацию к русской орфографии. В польском варианте (Czarnicki или Czernicki) ударение могло падать на второй слог. Спорных версий у этой фамилии немного: иногда её путают с фамилией Чернецкий, образованной от «чернец» (монах), но Черницький всё же топонимическая, а не профессиональная фамилия. Сословного барьера у неё не было — носители встречались и среди казацкой старшины, и среди крестьянства, что типично для фамилий на -ський/-цький на Правобережной Украине.