Фамилия Черноглазкин образована от прозвища Черноглазка. Оно ведет свое начало от словосочетания «черные глаза». Вероятно, прозвище отражало особенности внешности основателя фамилии (темно-карие глаза). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Черноглазка, со временем получил фамилию Черноглазкин.