Фамилия Черномисюк образована от прозвища Черномис, которое, вероятнее всего, восходит к двум украинским корням: «черн» в значении «черный» и «мiс» - «месить, мешать». Следовательно, прозвище Черномис может буквально означать «тот, кто мешает черное». Возможно, это прозвище указывает на род занятий предка: основатель рода Черномисюк мог заниматься размешиванием темной глины, краски или неких растворов для хозяйственных работ. Менее вероятно, что корень «мис» связан с украинским словом «миса», то есть «большая миска». В этом случае прозвище Черномис мог получить человек, занимавшийся изготовлением темных мисок, или же тот, кто пользовался старой, обгоревшей до черноты, покрывшейся копотью посудой. Так и прозвище Черномис закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Черномисюк.