Фамилия Черношейкина — женская форма фамилии Черношейкин, и её разбор сразу даёт ключ к происхождению. В основе лежит прозвище Черношейка, которое образовано сложением двух корней: «черн-» (от «чёрный») и «шейк-» (от «шея»). Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Черношейкин буквально означал «сын или потомок Черношейки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на -а/-я (ср. Бородин от Борода, Головин от Голова).

Прозвище Черношейка могли дать человеку по внешнему признаку — например, смуглой или загорелой шее, тёмному родимому пятну, или по привычке носить тёмную одежду, закрывающую шею. В крестьянском быту прозвища часто отражали заметные черты внешности, и «чёрная шея» не редкость: в говорах «черношейкой» могли называть и человека с грязной шеей, что в условиях полевых работ было обычным делом. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «черношейка» — так в некоторых областях называли птицу (например, чёрношейную поганку), но прозвища по птицам давались скорее по сходству поведения или голоса, а не по внешности.

Фамилия Черношейкин — редкая, сконцентрирована в основном в центральных и южных регионах России, особенно в Курской, Белгородской и Воронежской областях, а также встречается у украинских переселенцев. По данным переписей, носители фамилии в XIX веке числились преимущественно государственными крестьянами, что подтверждает её народное, недворянское происхождение. Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму с суффиксом «-ин», а не «-ов», что типично для прозвищ, оканчивающихся на мягкий согласный или гласный. В отличие от фамилий вроде Черношейко (украинский вариант) или Черношей (без суффикса), Черношейкин указывает на конкретную семейную линию, где прозвище закрепилось за родоначальником.

Таким образом, фамилия Черношейкина — это не просто «чёрная шея», а указание на предка, которого в деревне прозвали по характерной внешней черте. Никакого тайного смысла или дворянского титула за ней нет, но она честно хранит память о том, как выглядел или чем выделялся первый носитель этого прозвища.