Фамилия Чернозубкин построена по редкой для русских фамилий модели. Если большинство фамилий на -ин образованы от основ на -а/-я (Пушкин — от Пушка, Ильин — от Илья), то здесь мы видим суффикс -к-ин, присоединённый к прилагательному «чернозубый». Это не просто «сын Чернозуба» (как было бы в фамилии Чернозубов), а «сын того, кого прозвали Чернозубкой». Прозвище Чернозубка могло означать человека с тёмными, почерневшими зубами — возможно, из-за болезни, курения или работы с углём, сажей, дёгтем. Такие прозвища давали без злого умысла, по яркой внешней примете.

Основа фамилии — «чёрный зуб» — встречается и в других русских фамилиях (Чернозуб, Чернозубов), но форма на -кин указывает на севернорусское или сибирское происхождение. В говорах Архангельской, Вологодской, Вятской губерний и в Поморье суффикс -к-ин был особенно активен: так образовывали фамилии от прозвищ, оканчивающихся на -ка (Короткий — Коротков, но Коротка — Короткин). Чернозубкин, скорее всего, закрепился именно в тех краях, где прозвище произносили как «Чернозубка» — с аканьем или цоканьем, что и дало такую необычную грамматику.

В метрических книгах и переписях XVIII–XIX веков фамилия встречается редко. Можно предположить, что носители были государственными или дворцовыми крестьянами, реже — мещанами. Сословной элиты среди Чернозубкиных не было: фамилия слишком «простая» и привязана к физическому недостатку, чтобы её взяли дворяне. Зато она хорошо сохранилась в северных и уральских регионах — в современных базах данных фамилия чаще всего встречается в Кировской области, Пермском крае и Удмуртии.

Интересно, что фамилия Чернозубкин не попала в классические словари русских фамилий (Унбегаун, Никонов, Веселовский), что говорит о её локальном бытовании и малой численности рода. Это не «книжная», а живая, народная фамилия, которая возникла в среде, где прозвища давали по зубам, а не по профессии или отцу. Если ваш предок — Чернозубкин, он почти наверняка был крестьянином из северных губерний, и его прозвище запомнили по тёмной улыбке.