Фамилия Черняхоская — редкий случай, когда географическое происхождение почти очевидно, но написание ставит в тупик. Перед нами не стандартная русская фамилия на -ский, а скорее украинская или польская топонимическая фамилия, образованная от названия населённого пункта. Основа — «Черняхов» или «Черняхово». Таких сёл и городов на территории бывшей Речи Посполитой и Российской империи десятки, самый известный — город Черняховск (бывший Инстербург) в Калининградской области, но он переименован поздно, в 1946 году. Куда вероятнее, что фамилия происходит от старых поселений в Житомирской или Киевской области, например, от посёлка Черняхов, известного с XVII века.

Суффикс -ская (женский род) или -ский (мужской) указывает на то, что носитель — выходец из этого места, то есть «тот, кто из Черняхова». В польской традиции такие фамилии часто заканчивались на -ski и означали принадлежность к шляхте, но в восточнославянской среде это был просто способ идентификации по месту жительства. Написание через «о» — Черняхоская, а не Черняховская — может быть результатом диалектного произношения (аканья) или ошибки писаря при записи фамилии, который на слух передал безударный звук.

Корень фамилии — «чернях», что восходит к прилагательному «черный». В славянской антропонимике это могло быть прозвище человека с тёмными волосами или смуглой кожей, но в данном случае, скорее всего, это название самого поселения, получившего имя по первопоселенцу или по тёмному цвету почвы, леса. В отличие от фамилий Черняев или Чернов, где прямая связь с прозвищем, Черняхоская жёстко привязана к топониму.

Социальный состав носителей мог быть разным. Если фамилия польского происхождения — возможна шляхетская (однофамильная) знать герба «Погоня» или «Лелива». Если украинского или белорусского — чаще крестьяне или мещане, получившие фамилию при переписях по месту рождения. Важный нюанс: окончание -ская в русской среде почти всегда указывает на дворянское или духовное сословие, но у поляков и украинцев такие фамилии были массовыми и у простых людей.