Фамилия Черун — редкая и структурно необычная. В ней нет типичных русских фамильных суффиксов (-ов, -ин, -ский), что сразу выдаёт её нерусское или позднее происхождение. Скорее всего, перед нами украинская или белорусская фамилия, образованная без добавочного форманта: основа Черун сама стала фамилией. Такая модель (чистая основа + нулевой суффикс) типична для западнорусских земель, где фамилии нередко застывали в форме прозвища.

Корень «чер-» с большой вероятностью восходит к слову «чёрный». В славянской ономастике это один из самых частых цветовых признаков: «черный» означал либо тёмный цвет волос или кожи, либо мрачный нрав, либо социальный статус (чернь, простой народ). Но суффикс -ун указывает на активное действие или характерный признак. Сравните: бегун, говорун, шалун. Черун могло быть прозвищем человека, который «чернит» — то есть клевещет, злословит, или же пачкает что-то. В диалектах «черунить» могло означать «чернить, марать».

Есть и другая, менее вероятная версия: от личного имени Черун как производного от Чернь (Черня), Чернила — уменьшительных форм крестильных имён вроде Чернец. Но суффикс -ун для имён несвойственен, поэтому версия с прозвищем по действию выглядит убедительнее.

Географически фамилия встречается в основном на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в юго-западной Беларуси. В России она редка и, скорее всего, принесена переселенцами. В польском языке есть схожая фамилия Сzernun — с тем же корнем и значением.

Социальный контекст: фамилии на -ун без патронимического суффикса часто закреплялись за крестьянами или мещанами, так как дворянские роды предпочитали оформлять фамилии через -ов/-ев. Это не значит, что предки Черунов были непременно простолюдинами, но указывает на народную, не книжную природу прозвища.

Итог: фамилия Черун — прозвищная, украинского или белорусского происхождения, означающая «тот, кто чернит» (в прямом или переносном смысле). Её носители — потомки людей, получивших кличку по характерному поведению или занятию, связанному с чёрным цветом.