Фамилия Черунов — одна из тех, где этимология не лежит на поверхности. На первый взгляд в ней слышится что-то «черное», но на самом деле корень скорее всего не цветовой, а личный, и связан он с дохристианским именем или прозвищем.

В основе фамилии лежит имя или прозвище Черун. Это усеченная, народная форма от церковного имени Черувим (от херувим — ангельский чин). Такие «ангельские» имена, хоть и редко, но давали в крестьянской среде, особенно в северных и центральных губерниях России. Со временем сложное имя Черувим в бытовой речи сократили до Черун — так же, как Вонифатий превращался в Воню, а Евдоким — в Доку.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключенная, — происхождение от прозвища Черун, связанного с диалектным словом «черун» или «черунья». В некоторых говорах так называли черного, чумазого человека либо того, кто работал с сажей или углем (например, кузнеца или печника). Однако эта версия уступает первой: суффикс -ун в русских прозвищах чаще указывает на деятеля (бегун, крикун), а не на цвет, и для обозначения черного волоса или кожи обычно использовали прозвища Черный, Черныш, Чернавка.

Фамилия образована по стандартной модели: основа Черун + патронимический суффикс -ов, означающий «сын Черуна» или «потомок Черуна». Это типичная русская фамилия, равная по типу фамилиям Шатунов, Бегунов, Плясунов.

Географически фамилия Черунов встречается нечасто, но локально заметна в Вологодской и Архангельской областях, а также на Урале — в тех краях, где до XVIII века держались старые русские имена-прозвища. В переписных книгах XVII века можно найти крестьян с именем Черунко — это прямое указание на то, что основа бытовала в живой речи.

Таким образом, предок современных Черуновых, скорее всего, носил редкое имя Черун, данное ему при крещении в честь ангельского чина, и уже в XVI–XVII веках его потомки закрепили это имя в качестве фамилии.