Фамилия Честюнина — женская форма фамилии Честюнин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Суффикс -ин указывает на «притяжательное» происхождение: в русской ономастике фамилии на -ин (как и на -ов/-ев) образовывались от имён, прозвищ или названий профессий, оканчивающихся на -а или -я. Исходная основа здесь — Честюня. Это древнерусское нецерковное имя или прозвище, которое, скорее всего, связано с прилагательным «честный». В старину «честной» означало не только «порядочный», но и «почтенный», «уважаемый», «достойный чести». Уменьшительно-ласкательный суффикс -юн- (как в именах Горюня, Веселюня) придавал прозвищу бытовой, «домашний» оттенок: Честюня — это «маленький честный человек» или «честный малый». Таким образом, фамилия произошла от мирского имени-характеристики, которое давали человеку за его добросовестность и порядочность.

География фамилии довольно узкая. По данным современных телефонных справочников и архивных записей, Честюнины чаще всего встречаются в Пермском крае, Удмуртии и Кировской области. Это регионы бывшего Вятского и Пермского наместничеств, где в XVIII–XIX веках было много старообрядческих общин и крестьянских фамилий, образованных от прозвищ, а не от крестильных имён. Возможно, предки Честюниных были государственными или экономическими крестьянами, а фамилия закрепилась за целым родом, жившим в одной деревне.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что модель Честюня — не самая распространённая. Более часты варианты от полной формы: Честнов, Честных (на -ов и -ых), а также Честный. Фамилия Честюнин — более редкая, сохранившая древнюю уменьшительную форму. В ономастических словарях фамилию не всегда выделяют отдельно, но она вписывается в общий ряд прозвищ от качеств человека, таких как Добрыня (от добрый), Храбрун или Веселун. В дореволюционных метрических книгах по Вятской губернии встречаются записи о крестьянах Честюниных, что подтверждает её крестьянское, а не дворянское происхождение: в списках дворянских родов эта фамилия не значится.

Итак, предки носительницы фамилии Честюнина — скорее всего, крестьяне северо-востока европейской России, а сама фамилия происходит от прозвища Честюня, данного человеку за честность и почтенный нрав. Это не выдуманная красивая история, а типичный для тех мест случай, когда личное качество стало родовым именем.