Фамилия Чипурнова образована от прозвища Чипурной. В её основе лежит старинное диалектное слово, которое в разных говорах имело близкие, но не тождественные значения. В псковских и тверских говорах «чипурной» — это опрятный, чистоплотный, щеголеватый человек, тот, кто следит за своей одеждой и внешностью. В словаре Владимира Даля зафиксирован глагол «чипуриться» — наряжаться, прихорашиваться, и прилагательное «чипурный» — щегольской, опрятный. Таким образом, Чипурным в крестьянской среде могли прозвать аккуратиста, который, в отличие от большинства односельчан, особенно тщательно следил за порядком в доме или за своим костюмом.

Модель образования фамилии проста и типична для русского Севера и центральных областей: основа «Чипурн-» плюс типичный русский суффикс принадлежности -ов-. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне с прозвищем Чипурной, например, в переписных книгах Вологодского уезда. Женская форма Чипурнова — это «дочь или жена Чипурного», а сам родоначальник, скорее всего, был вольным или дворцовым крестьянином, а не дворянином, поскольку фамилия не имеет типичных дворянских суффиксов (например, -ский) и не встречается в родословных книгах.

Существует и менее вероятная, но лингвистически возможная версия: связь с украинским или белорусским диалектным «чипур» — черепок, осколок, или с глаголом «чипать» (трогать, задевать). Однако для русской фамилии Чипурнова основное значение — «опрятный» — выглядит убедительнее, так как оно хорошо объясняет мотивацию прозвища и имеет параллели в других фамилиях того же корня (Чистоплюев, Опрятков). Встречается фамилия преимущественно в Поволжье и на юге России, что может говорить о миграции носителей из северных областей в более позднее время.