Фамилия Чистанова — женская форма фамилии Чистанов, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы через суффикс -ов. Мужской вариант Чистанов, в свою очередь, происходит от прозвища или нецерковного имени Чистан. В чём тут загадка: корень «чист-» очевидно связан с прилагательным «чистый», но суффикс -ан в основе указывает на то, что это не просто прилагательное, а производное имя с оттенком ласкательности или уменьшительности. То есть Чистан — это «чистенький», «опрятный» или, в переносном смысле, «честный, непорочный человек». Такие имена на -ан (Иван, Петран, Чистан) в старину давали не при крещении, а в быту, как характеристику.

Словообразовательная цепочка проста: Чист(ый) + -ан → Чистан, а затем Чистан + -ов → Чистанов. Фамилия фиксируется в основном в центральных и северных регионах России, где были распространены «чистые» прозвища. Встречаются также варианты Чистиков, Чистов, Чистяков, но Чистанов стоит особняком из-за редкого суффикса -ан, который чаще встречается в украинской и белорусской ономастике, чем в русской. Это наводит на мысль, что предки носителей фамилии могли быть выходцами из западнорусских земель или переселенцами, сохранившими диалектную форму.

По сословной принадлежности однозначных данных нет: Чистановы могли быть как крестьянами (прозвище давали за опрятность или за то, что человек «чисто» работал, не пачкался), так и мещанами или духовенством — в среде священников «чистый» нередко означало «безгрешный». В любом случае, фамилия недвусмысленно указывает на положительное качество, которое предок получил в качестве имени или прозвища. В современных справочниках фамилия Чистанова не относится к числу массовых, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска: чем реже фамилия, тем точнее можно восстановить историю рода.