Фамилия Чмихунов — один из тех случаев, где основа настолько неочевидна, что сразу вызывает вопросы. Если отбросить типичный суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Чмихунов), то корень упирается в нестандартное прозвище или имя Чмихун. В русской ономастике это редкий случай, и объяснить его можно через диалектные слова или искажения.

Самая вероятная версия связывает фамилию с украинским или южнорусским диалектным глаголом «чмихати» — чихать, сморкаться, иногда фыркать. В таком случае Чмихун — прозвище человека с заметной особенностью: либо он часто и громко чихал, либо имел привычку «чмихать» носом. Альтернатива — связь с «чмирь» или «чмур» (пасмурный, хмурый человек), но фонетически это менее убедительно: переход «р» в «х» нехарактерен для славянских говоров. Прозвища по физиологическим признакам — одна из древнейших моделей, поэтому версия с чиханием выглядит естественной.

Суффикс -ун в основе (Чмих-ун) типичен для русских прозвищ, образованных от глаголов: говорун, крикун, ворчун. Здесь он выполняет ту же роль — называет человека по действию. То есть Чмихун — «тот, кто чмихает». К фамилии это прозвище добавили через стандартный патронимический суффикс -ов, что значит «сын Чмихуна». Таким образом, первый носитель фамилии был потомком человека с таким прозвищем.

Географически фамилия редкая, встречается преимущественно на юге России и, возможно, в украинских регионах, где диалектная лексика сохранилась лучше. Появление в официальных документах (переписях, ревизских сказках) могло быть случайным: священник или писарь записал прозвище так, как услышал, не пытаясь «исправить» его на более благозвучное. Сословная принадлежность предков неясна — прозвище могло закрепиться и у крестьян, и у казаков, но в дворянскую среду такая форма вряд ли проникла.

В сравнении с однокоренными фамилиями (Чмихов, Чмихин) вариант Чмихунов — наиболее полный, с сохранением суффикса деятеля. Если бы основа была от имени Чмих (гипотетическое сокращение от Чеслав или Чемодан), то форма была бы Чмихов. Наличие -ун- указывает именно на прозвищное происхождение, а не на крестильное имя.