Фамилия Чмыхунов — один из тех случаев, где исходное прозвище звучит куда грубее, чем получившаяся фамилия. Основа здесь — «чмых», слово с богатой и неоднозначной историей. В русских говорах «чмых» могло означать и «запах, дух», и «пьяницу» (от «чмыхнуть» — выпить), и даже «нечистую силу» или «черта». В сибирских и уральских диалектах «чмыхой» называли человека угрюмого, нелюдимого или неопрятного. Скорее всего, именно такое прозвище — Чмыхун — и легло в основу фамилии.

Суффикс -ун в прозвищах типичен для характеристики человека по действию или свойству: врун, крикун, бегун. Чмыхун — тот, кто «чмыхит», то есть издает неприятный запах, пьет или хмурится. Фамилия образована по стандартной русской модели через притяжательный суффикс -ов: Чмыхунов — буквально «сын или потомок Чмыхуна». Это патронимическая фамилия, каких большинство в России.

Интересна география. Фамилия Чмыхунов редкая, но встречается в документах XVII–XVIII веков на Русском Севере и в Приуралье. В переписных книгах Вятки и Перми Великой попадаются крестьяне с прозвищем Чмых, Чмыхун. Это указывает на то, что фамилия возникла в среде черносошных крестьян или посадских людей, а не дворянства. Никаких громких исторических родов с такой фамилией нет — она из народной гущи.

В ономастических справочниках (например, в работах Б. Унбегауна) фамилии на -унов разбираются как типично русские, образованные от прозвищ с суффиксом -ун. Чмыхунов стоит в одном ряду с Хархуновым, Хрюкаловым, Шмыгуновым — все они отражают бытовую, часто сниженную лексику, которая в фамилиях теряла негативный оттенок и становилась просто родовым именем.

Однокоренные фамилии — Чмыхов, Чмырев, Чмыхин. Чмыхунов отличается именно суффиксом -ун, который делает прозвище более активным: не просто «чмых», а «тот, кто делает чмых». Современным носителям фамилии стоит знать: их предок, скорее всего, был человеком с яркой, возможно, не самой лестной характеристикой, которую спустя века перестали замечать, оставив только звучную фамилию.