Фамилия Чубаленков — редкий случай, когда прозвищное имя и патронимический суффикс образовали нестандартную цепочку. Сразу бросается в глаза суффикс -енк(ов): это не обычное -ов или -ев, а сложная конструкция, характерная для украинской и южнорусской ономастики. Фактически перед нами «обрусевшая» украинская фамилия на -енко, к которой в русской среде добавили ещё один суффикс принадлежности — -ов. Исходная форма, Чубаленко, означала «сын или потомок Чубала».

Основа Чубал- — производное от прозвища Чубал. В русских говорах «чубалый» означало «чубатый, с чубом», то есть человек с длинной прядью волос, которую не стригли, а носили как знак отличия (например, запорожские казаки). Но есть и другая, более прозаичная версия: в южных диалектах «чубалом» могли называть лохматого, неопрятного человека или, наоборот, того, кто щеголял пышной шевелюрой. Прозвище могло закрепиться за казаком, крестьянином или мещанином — сословной привязки нет, но географически фамилия тяготеет к землям бывшей Слобожанщины и юга России.

Сравните с однокоренными: Чуб, Чубаров, Чубатенко. У Чубаленкова двойная «украинизация»: сначала уменьшительный суффикс -л- (Чубал — «маленький чуб» или «носитель чуба»), потом фамильный -енко. В XIX веке при переписях и рекрутских наборах на русской службе форму Чубаленко часто русифицировали, добавляя -ов, чтобы фамилия звучала привычнее для великорусского уха. Так Чубаленко стал Чубаленковым.

Встречаемость фамилии невысокая, сосредоточена в Курской, Белгородской, Воронежской областях, а также на Кубани. Это след миграции малороссийского населения на восток и юг в XVII–XVIII веках. Носители фамилии, скорее всего, потомки крестьян или казаков, получивших прозвище по заметной внешней примете — чубу. Никакой связи с «чубом» как деталью одежды или причёски «под горшок» здесь нет: прозвище было личным, а не родовым, и лишь потом закрепилось за семьёй.