Фамилия Чубатов образована от прозвища Чубатый, которое ведет свое начало от аналогичного прилагательного со значением «имеющий чуб (хохол, вихор, взбитый или отращенный локон)». Согласно другой версии, прозвище Чубатый восходит к украинскому глаголу «чубити» - «колотить», «бить кого-либо, хватая за чуб». В таком случае Чубатым называли вспыльчивого, горячего человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Чубатый, со временем получил фамилию Чубатов.