Фамилия Чуборев — редкий пример, где на слух почти очевидная основа на деле оказывается не такой простой. Первое, что приходит в голову: связь со словом «чуб» — прядь волос, хохол, казачий оселедец. Но если бы фамилия была образована напрямую от «чуб», мы бы скорее ждали форму Чубов или Чубин. Суффикс -ев указывает на то, что в основе лежит слово или прозвище, оканчивающееся на мягкий согласный или -й. Поэтому логичнее предположить, что исходным было прозвище Чубарь.

В русских говорах «чубарь» — это не только человек с чубом, но и, как ни странно, название некоторых пород собак или даже лошадей с пятнистым окрасом (ср. «чубарый» — пестрый, в яблоках). Так могли прозвать человека за приметную внешность — либо за выделяющуюся шевелюру, либо за рябоватость лица или пестрый, рябой цвет глаз. В пользу версии с прозвищем Чубарь говорит и словообразовательная модель: Чубарь → Чубарев (чей сын? — Чубарев) — точно так же, как от Бондарь пошла фамилия Бондарев, от Псарь — Псарев.

Менее вероятна, но не исключена версия от тюркского имени Чобур (Çobur) — «коренастый», «кряжистый», которое могло попасть в русскую среду через контакты с татарами или башкирами. Тогда фамилия Чуборев могла бы означать «потомок Чобура», но для этого пришлось бы допустить, что исходное имя звучало как Чубар или Чобарь, а написание закрепилось через «о» под влиянием аканья.

Географически фамилия встречается точечно, преимущественно в центральных и южных областях России — в Воронежской, Ростовской, Волгоградской областях, где исторически были сильны казачьи традиции с их культом чуба. Встречается и написание Чубарев — более прозрачное по происхождению. Чуборев, с буквой «о» во втором слоге, могло закрепиться в документах из-за диалектного произношения (чубарь — чубарёв, а на письме — через «о»). Сословная принадлежность носителей, скорее всего, была крестьянской или казачьей: фамилия не аристократическая, без суффикса -ский, и не духовная, а патронимическая, от прозвища, данного по внешнему признаку.