Фамилия Чуборко — редкий пример украинской фамилии, образованной по модели, характерной для западных регионов. Суффикс -ко здесь не уменьшительный, а патронимический: он указывал на сына или потомка человека, носившего прозвище Чубарь или Чубор. То есть Чуборко — это «маленький Чубарь», «сын Чубаря».

Основа фамилии — слово «чуб» или «чубарь». В украинских говорах «чубарь» — это либо человек с длинным чубом (хохлом), либо тот, кто носит оселедец (длинный клок волос на выбритой голове). Такая прическа была традиционной у запорожских казаков. Поэтому первая и самая вероятная версия: предок Чуборко был казаком или просто заметным человеком, которого выделяла его прическа. Менее распространенное значение «чубаря» — конь или бык с белым пятном на лбу (от «чубарый» — пестрый, с белой отметиной). В этом случае прозвище могло относиться к внешности или к масти скота, но для человека такое прозвище — скорее исключение.

Модель с суффиксом -ко дает ключ к географии. Фамилии на -ко массово бытуют на Правобережной Украине, особенно в Черкасской, Киевской, Полтавской и Житомирской областях. Если бы фамилия была русской, она звучала бы как Чубарев или Чубаров. Украинский суффикс -ко, в отличие от русского -ов, не склонялся по правилам великорусских фамилий и сохранил более архаичную форму. Встречается также вариант написания Чубарко — это та же основа, но с другим суффиксальным оформлением.

В дореволюционных ревизских сказках и метрических книгах Чуборко встречается преимущественно среди крестьян и казаков. Дворянских родов с такой фамилией нет — это фамилия простого сословия, что типично для украинских прозвищных фамилий. В советское время носители фамилии мигрировали по всей стране, но ядро осталось в центральной Украине. Известных деятелей культуры или науки с такой фамилией нет, но это не делает её менее ценной для поиска корней: Чуборко — маркер конкретного региона и социальной среды.