Фамилия Чубарко звучит по-южнорусски и по-украински, и это не случайно: её основа — прозвище Чубарь, которое давали человеку с заметным, торчащим чубом. В старину «чуб» — это не просто прядь волос, а часто оселедец, который запорожские казаки носили как знак принадлежности к вольному воинству. Соответственно, Чубарём могли прозвать казака, гуляку или просто парня с непокорной шевелюрой.

Суффикс -ко в фамилии Чубарко — типичный для украинской и белорусской ономастики. Он выполняет сразу две роли: уменьшительную и патронимическую. То есть Чубарко — это буквально «маленький Чубарь» или, что чаще, «сын Чубаря». Такая модель широко распространена на Левобережной Украине, в Полтавской, Черниговской и Харьковской губерниях, а также в южнорусских областях, куда активно переселялись казаки и крестьяне.

Стоит различать Чубарко и более частотную фамилию Чубаров. Вариант на -ко более демократичен и «младший» по возрасту: он часто фиксировался у крестьян и казаков, тогда как Чубаровы могли принадлежать к служилому сословию. В документах XVIII–XIX веков Чубарко встречается в реестрах запорожских казаков и в метрических книгах сёл Екатеринославщины и Херсонщины.

Есть и вторая, менее очевидная версия происхождения. В некоторых говорах «чубарь» — это не только человек с чубом, но и вид дикого растения (например, чабреца) или даже мелкая рыбёшка. Однако в основе фамилии, скорее всего, лежит именно внешний признак: прозвища по причёске давали повсеместно, и они легко закреплялись в качестве родовых имён. Так что предки современных Чубарко с большой вероятностью были либо казаками, либо крестьянами южных губерний, выделявшимися своей «чубатостью».