Фамилия Чубарин — яркий пример того, как прозвище, данное по внешнему признаку, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит слово «чуб» — прядь волос, хохол, оселедец, который традиционно носили запорожские казаки. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Чубарин буквально означает «сын или потомок Чубара», то есть человека, которого за характерную причёску прозвали Чубаром.

Слово «чубар» в русских говорах имело и другое значение — так называли пестрого, рябого коня или быка. Поэтому не исключено, что прозвище мог получить не только обладатель заметного чуба, но и человек, ухаживающий за такой лошадью, или даже тот, кто сам имел пёструю, рябую внешность (например, веснушки). В фамилиях на -ин часто скрываются прозвища на -ара, -ура, которые в живой речи обозначали носителя яркого признака: Горбатый — Горбарь — Горбарин, Косой — Косарь — Косарин. Чубарин стоит в этом же ряду.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям, где слово «чуб» было особенно употребительно. В XIX веке Чубарины встречались в Курской, Воронежской, Харьковской губерниях — на территории бывшей Слобожанщины, где смешались великорусские и малороссийские говоры. Именно здесь прозвище, данное по казацкому оселедцу, легко могло стать фамилией.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму без «беглого» гласного: логично было бы ожидать «Чубрин», но язык закрепил полную основу «чубар». Это говорит о том, что прозвище было именно Чубар, а не Чубер. Встречаются и варианты написания через «о» — Чобарин, что отражает акающее произношение южных говоров. Таким образом, Чубарин — это фамилия-портрет, которая хранит память о внешности или прозвище своего первого носителя, жившего в казачьей среде.