Фамилия Чукча — редкий случай в русской ономастике, когда прозвище по национальности стало фамилией без адаптирующих суффиксов. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, которые образуются с помощью -ов, -ев, -ин, -ский (Чуков, Чукчин, Чуковский), фамилия Чукча осталась в форме чистого существительного. Это так называемая «неоформленная» или «нулевая» фамилия, характерная в основном для украинской и белорусской традиции (Шевченко, Коваль), а в русской среде встречающаяся редко, чаще в Сибири и на Севере.

Основа фамилии прозрачна: слово «чукча» — этноним, обозначающий коренной народ Чукотки. В русском языке это слово закрепилось с XVIII века, после присоединения Чукотки и первых контактов с чукчами. Прозвище Чукча могли дать человеку, который внешне или по поведению напоминал чукчу (например, носил меховую одежду, был молчалив или, наоборот, рассказывал «чукотские» истории), либо тому, кто торговал с чукчами, жил среди них или вернулся из долгой поездки на Север.

Версия о том, что фамилия происходит от тюркского корня «чук» (свинья, кабан) или от диалектного «чукча» (неопрятный человек), менее правдоподобна. Этноним перевешивает по частоте употребления в прозвищах, и именно он лёг в основу фамилии. Географически фамилия Чукча встречается единично — в основном в Якутии, Магаданской области и на Камчатке, что подтверждает её северное происхождение. За пределами Дальнего Востока она почти не фиксируется, что делает её ярким региональным маркером.