Фамилия Чухранина — женская форма, а её мужской вариант — Чухранин. Основа здесь — прозвище Чухрана, которое, скорее всего, дали человеку с неопрятным видом или небрежной причёской. В русских говорах слово «чухра» или «чухря» означало нечто взлохмаченное, растрёпанное, а также могло относиться к нечёсаному, неряшливому человеку. Глагол «чухрать» имел значения «драть, царапать, чесать» — отсюда прямая ассоциация с тем, кто ходит непричёсанным, с торчащими волосами.

Модель образования простая и типичная для восточнославянских фамилий: к основе прозвища Чухрана добавили патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Чухраны). Такая схема характерна для фамилий, сложившихся в крестьянской и посадской среде к XVII–XVIII векам. Суффикс -ин, в отличие от -ов, обычно присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я, что и произошло в этом случае.

Интересно, что у фамилии есть «говорящий» однокоренной ряд: Чухрин, Чухряев, Чухраев. Все они образованы от тех же диалектных корней, связанных с неопрятностью или взлохмаченностью. При этом Чухранина стоит несколько особняком: если в фамилиях на -ев и -ов основа чаще всего усекалась (Чухр-), то здесь сохранилась полная форма прозвища с окончанием -а, что реже встречается в документах XVII века.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодской, Костромской, Кировской, где диалектное слово «чухра» было в ходу. Встречается она нечасто, что объясняется узкой локальной основой прозвища. В метрических книгах XIX века Чухранины фиксируются в основном как крестьяне государственные или бывшие помещичьи, без связи с каким-либо ремеслом или сословным статусом — фамилия осталась «бытовой», описывающей внешность, а не занятие.