Фамилия Чулибина — женская форма от мужской фамилии Чулибин. Её основа — прозвище или нецерковное имя Чулиба. Слово «чулиба» в русских говорах не зафиксировано в словарях как нарицательное, но его корень «чул-» отчётливо проступает в диалектных словах: «чула» (чулан, клеть) или «чулить» (прятать, таить). В северных и сибирских говорах «чулить» означало также «хитрить, лукавить». Поэтому Чулибой могли прозвать человека скрытного, нелюдимого или, наоборот, того, кто мастерски прятал вещи.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Чулибин, то есть сын или потомок Чулибы. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а. Если бы основа оканчивалась на согласный, мы бы получили фамилию Чулибов, но форма на -ин говорит о древней основе с окончанием -а.

Географически фамилия редкая. По данным открытых источников, Чулибины встречаются в основном в Вологодской и Архангельской областях, что косвенно подтверждает северное происхождение корня. В старину в этих краях «чулить» употреблялось именно в значении «таиться» — возможно, предок носителя фамилии был человеком замкнутым или имел прозвище за склонность к уединению.

Есть и менее вероятная версия: связь с тюркским «чул» (степь, пустыня) или «чулак» (безрукий). Но для русского Севера такое заимствование маловероятно, и фамилия Чулибина — скорее всего, чисто русская, от местного диалектного слова.

Встречается также вариант написания «Чулибина» с ударением на второй слог — Чулибина, что характерно для северных говоров, где часто переносят ударение на основу. В документах XVIII–XIX веков эта фамилия могла записываться как «Чулибинъ», но корень оставался неизменным.