Фамилия Чупукова — женская форма мужской фамилии Чупуков. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать основу «Чупук». Это прозвище или имя, которое могло возникнуть из нескольких источников.

Первый и наиболее вероятный вариант — тюркское происхождение. В тюркских языках слово «чубук» (или «чупур») означало «прут», «ветка», «трость». В переносном смысле так могли назвать высокого, худого человека, похожего на хворостину. Прозвище закреплялось за человеком, а затем переходило в фамилию через русский патронимический суффикс -ов. В русском языке встречается чередование «б/п» (как в словах «зуб» — «зубки»), поэтому «Чубук» могло превратиться в «Чупок» или «Чупук». Таким образом, Чупуков — это «сын Чупука», то есть человека с прозвищем, связанным с худобой или ростом.

Вторая версия отсылает к профессии. В некоторых диалектах «чупук» — это элемент конской упряжи или деталь ткацкого станка. Мастер, делавший такие детали, мог получить прозвище Чупук, а его дети — фамилию Чупуковы. Эта версия менее распространена, но имеет право на существование, особенно в регионах, где были развиты ремесла.

Третий, более редкий вариант — связь с диалектным словом «чупа» (губа, рот) или глаголом «чупать» (целовать, сосать). В таком случае прозвище Чупук могло относиться к человеку с пухлыми губами или к тому, кто любил поесть. Однако эта гипотеза слабее тюркской, так как не объясняет характерный для фамилии суффикс -ук.

Фамилия Чупукова географически тяготеет к южным регионам России и Поволжью — зонам активных контактов с тюркскими народами. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении. Сословно носители фамилии в основном были крестьянами или мещанами, так как прозвища такого типа редко закреплялись в дворянских родах.

В итоге: с большой вероятностью предки Чупуковых носили прозвище Чупук (от тюркского «чубук» — прут, тонкая ветка), данное за высокий рост или худощавое телосложение.