Фамилия Данечко звучит на украинский лад и образована по характерной для восточнославянских языков модели. Суффикс -енко — один из самых распространённых в украинской ономастике, он указывает на происхождение по отцу: буквально «сын Данека» или «потомок Данека». В русском языке аналогичную роль выполняют суффиксы -ов/-ев, -ин, поэтому фамилия Данечко — типичный пример украинской «патронимической» фамилии, которая закрепилась в южных и центральных регионах бывшей Российской империи.

Основа фамилии — имя Данек. Это уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Даниил (в народном произношении часто — Данило). Даниил переводится с древнееврейского как «Бог — мой судья». В украинской среде имя Данило давало множество производных: Данько, Данек, Данилко, Данусь. Форма «Данек» менее частотна, чем «Данько», но именно она легла в основу фамилии Данечко. Таким образом, предок по мужской линии, вероятно, носил имя Данек (или его могли так звать в обиходе), а его дети стали писаться как «Данечко» — то есть «Данековы».

Встречается фамилия Данечко в основном в Украине, особенно в центральных и восточных областях, а также среди украинской диаспоры. В России она редка и часто воспринимается как «нетипичная» для русского слуха из-за суффикса. В исторических документах фамилия могла записываться с вариациями: Данечко, Данечков (при обрусении) или Даничко (под влиянием полной формы имени). Сословная принадлежность носителей, скорее всего, была крестьянской или казачьей — именно в этих средах патронимы на -енко закреплялись в качестве фамилий в XVII–XIX веках.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Даниленко, Данильченко, Данько, — то Данечко стоит особняком из-за редкой основы «Данек». Это не описка и не искажение, а самостоятельная уменьшительная форма, зафиксированная в украинских говорах. Споров о происхождении фамилии почти нет: она прозрачна по словообразованию и не требует привлечения надуманных версий. Единственное, что может сбивать с толку, — написание через «е» после «н», но это как раз и выдаёт украинское произношение (с мягким «н»).