Фамилия Данечкин — редкий случай, когда суффикс -ин присоединился не к имени, а к ласкательной форме другого имени. Если бы фамилия была образована напрямую от имени Данечка (уменьшительное от Даниил), мы бы получили Данечкин — и это логично. Но здесь основа не Данечка, а Данек.

Разберём цепочку: имя Даниил дало краткую форму Даня. От неё образовали уменьшительное Даня → Данек (с суффиксом -ек, как «сынок» от «сын»). А уже от формы Данек возникло притяжательное прилагательное «Данечкин» — то есть «сын Данека». Обычный суффикс -ин в фамилиях указывает на принадлежность: чей? — Данечкин. Так что предок носителя фамилии, скорее всего, звался Данек, что было ласковым прозвищем для мальчика или взрослого по имени Даниил.

В русских говорах форма Данек встречалась нечасто, и фамилия Данечкин — одна из тех, что закрепилась именно за этим вариантом, а не за более привычным Данилов или Данилкин. Географически такие фамилии тяготеют к центральным и северным областям России, где суффикс -ек в уменьшительных именах был активнее. В переписях XIX века Данечкины встречаются в Тверской и Ярославской губерниях, но это редкая фамилия: в современных справочниках она не входит даже в первую тысячу по частоте.

Споров вокруг происхождения почти нет. Единственная альтернативная версия — связь с прозвищем Данек от диалектного глагола «данекать» (ворчать, брюзжать), но она слабая: в словарях такого глагола нет, а прозвище «Данек» нигде не зафиксировано как самостоятельное, без имени. Поэтому версия с именем Даниил — основная и наиболее правдоподобная.

По сословному составу Данечкины — почти поголовно крестьяне и мещане. Дворянских родов с такой фамилией нет в гербовниках, что тоже подтверждает её народное, «уличное» происхождение: фамилию давали по отцу или деду, которого в деревне знали как Данека.