Вероятно, Дёнышев — адаптированный русскими вариант тюркской фамилии Денишев, которое образована от основы «тен-» (или «ден-») - «рассвет» с помощью уменьшительно-ласкательного аффикса -ш или присоединения слова «иш» («близкий человек, друг»). Так могли назвать ребёнка, родившегося на рассвете. Со временем фамилия Денишев могла быть переосмыслена русскими, которые ошибочно стали возводить её к слову «дно», «донышко» (в просторечии «дёнышко»), из-за чего в фамилии появилась буква «ё» вместо «е». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Дёнышевых можно лишь на основании генеалогических исследований.