Фамилия Додерко — типичный пример украинской модели фамилий на -ко, которая в XVI–XVII веках была распространена в Поднепровье, на Слобожанщине и Запорожье. Суффикс -ко в украинской ономастике выполнял две функции: уменьшительно-ласкательную (как в именах Дмитро → Дмитрко) и патронимическую, то есть указывал на потомка («сын такого-то»). В фамилии Додерко он работает именно как патронимический: «сын Додера».

Основа фамилии — прозвище Додер. Его связывают с украинским глаголом додертися — «выцарапывать узор на чем-либо». В этом случае прозвище мог получить человек, занимавшийся резьбой по дереву, чеканкой по металлу или другим ремеслом, связанным с нанесением узора. Слово додертися — довольно редкое даже в диалектах, поэтому фамилия Додерко встречается нечасто и имеет узкую региональную привязку, скорее всего к центральной или западной Украине.

Менее вероятная, но возможная версия связывает прозвище Додер с польским dodrzeć — «добраться, дойти». Тогда Додером называли человека, который добивался своего, был настойчивым. Однако украинская основа выглядит убедительнее, потому что суффикс -ко в фамилиях почти всегда указывает на восточнославянское, а не польское происхождение.

Поскольку фамилия образована от прозвища, а не от крестильного имени, её носители, скорее всего, происходили из крестьян или казаков — сословий, где фамилии часто закреплялись по роду занятий или личным качествам, а не по отцу. В официальных документах прозвище Додер со временем вытеснило наследственное имя, и фамилия Додерко закрепилась за потомками этого человека.

Сравните с однокоренными фамилиями: Додерчук, Додерев, Додеренко. Все они образованы от той же основы, но с разными суффиксами, что указывает на разные ветви одного рода или разные территории бытования. Додерко — самая компактная форма, типичная для фамилий, которые сложились в среде украинского казачества.